好吧，这次问题就简单了。还是BOM的问题。只是文件太多，不方便一个个手工检查。

下面代码就是自动去除BOM的，建个X.PHP根目录运行，OK正常佐。

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<?php
header('content-Type: text/html; charset=utf-8');
if(isset($_GET['dir'])){ //设置文件目录，如果没有设置，则自动设置为当前文件所在目录
$basedir=$_GET['dir'];
}else{
$basedir='.';
}
$auto=1;/*设置为1标示检测BOM并去除，设置为0标示只进行BOM检测，不去除*/

echo '当前查找的目录为：'.$basedir.'当前的设置是：';
echo $auto?'检测文件BOM同时去除检测到BOM文件的BOM<br />':'只检测文件BOM不执行去除BOM操作<br />';

checkdir($basedir);
function checkdir($basedir){
if($dh=opendir($basedir)){
while (($file=readdir($dh)) !== false){
if($file != '.' && $file != '..'){
if(!is_dir($basedir.'/'.$file)){
echo '文件: '.$basedir.'/'.$file .checkBOM($basedir.'/'.$file).' <br>';
}else{
$dirname=$basedir.'/'.$file;
checkdir($dirname);
}
}
}
closedir($dh);
}
}
function checkBOM($filename){
global $auto;
$contents=file_get_contents($filename);
$charset[1]=substr($contents,0,1);
$charset[2]=substr($contents,1,1);
$charset[3]=substr($contents,2,1);
if(ord($charset[1])==239 && ord($charset[2])==187 && ord($charset[3])==191){
if($auto==1){
$rest=substr($contents,3);
rewrite($filename,$rest);
return (' <font color=red>找到BOM并已自动去除</font>');
}else{
return (' <font color=red>找到BOM</font>');
}
}else{
return (' 没有找到BOM');
}
}
function rewrite($filename,$data){
$filenum=fopen($filename,'w');
flock($filenum,LOCK_EX);
fwrite($filenum,$data);
fclose($filenum);
}
?>